O ProPESCA, reflecte e responde à estratégia do governo para o sector, como apresentado no Plano Estratégico para o Subsector de Pesca Artesanal (PESPA) e o Plano de Acção para a Redução da Pobreza Absoluta (PARPA II), e é compatível com o Programa de Oportunidades Estratégicas do País (COSOP) do FIDA. Baseia-se na experiência do PPABAS e de outros dois projectos de pesca artesanal e emprega várias modalidades e técnicas de implementação bem sucedidas usadas por estes projectos, mas dentro de uma concepção mais simplificada enfocada sobre a cadeia de valores da pesca, desde a captura até ao mercado final.